Le chimiste et officier SS Kurt Gerstein fournit aux nazis un gaz toxique qu'il croit destiné à la désinfection des camps de concentration. Lorsqu'il découvre le véritable usage du poison, Gerstein décide d'en informer le nonce de Berlin dans l'espoir qu'il alerte le Vatican. Mais seul le jeune jésuite Riccardo Fontana prend l'affaire au sérieux. Rapidement convaincu de l'existence des camps de la mort, le religieux utilise ses entrées au Vatican pour alerter en personne le pape Pie XII. Mais sa démarche demeure lettre morte. Devant le silence du Saint-Père, Riccardo est amené à poser un geste d'éclat. De son côté, Kurt Gerstein se rendra aux Français et écrira un rapport sur tout ce qu'il sait des horreurs nazies.